O ile leczenie endodontyczne z mikroskopem jest zwykle niezwykle starannym zabiegiem, czasami z powodu postępujących zmian chorobowych nieuniknione jest ponowne leczenie endodontyczne . W znakomitej większości przypadków najlepiej podejmować się ponownego leczenia swojego zęba. Ekstrakcja zęba skutkuje pojawieniem się niekomfortowej luki, którą trzeba uzupełnić nie tylko ze względu na estetykę uśmiechu. Pusta przestrzeń wpływa na stopniowy zanik kości, a także prowadzi do rozchwiania obocznych zębów, którym brakuje właściwego podparcia. Oprócz tego uzupełnienie luki zębowej wiąże się z nowym kosztem jakim jest wstawienie protezy. Niezależnie od tego, czy wybierzemy implant zęba czy np. most protetyczny, oznacza to nowe wizyty w gabinecie dentystycznym i ciągłe leczenie.
Dlatego nawet gdy dany ząb był już leczony kanałowo wcześniej, powinno się przemyśleć powtórne leczenie endodontyczne. Co prawda powtórny zabieg, może stać się cięższy niż wcześniejszy, wprawiony stomatolog endodonta, dołoży wszelkich starań, by wykonać leczenie poprawnie. Wznowione leczenie kanałowe przeprowadza się zwykle, jeżeli pojawią się kanały niewyleczone przy wcześniejszym zabiegu, dlatego że np. nie były one uprzednio dostrzeżone. Reakcja dentysty endodonty konieczna jest w sytuacji perforacji komory albo korzenia zęba oraz jeżeli w kanale zostało narzędzie dentystyczne. Usunięcie zęba zwykle zaleca się tylko wtedy, jeżeli nie ma możliwości właściwego opracowania kanału.